南開大學2012自主招生確認的自主選拔錄取人選須由學生所在中學張榜公布，省級招生辦公室在本省相關媒體公示，南開大學也將通過南開大學本科生招生信息網公示，并報送教育部相關網站公示。南開大學2012自主招生選拔合格考生人數將不超過本年度招生計劃的5%。
所有自主選拔考生需參加由南開大學2012自主招生選拔錄取考核小組（主管校長任組長，成員為相關學科的專家、學者）組織的選拔測試，學校招生工作領導小組根據考生綜合成績（文化課考試*80%+面試成績*20%）分省排名，分省確定人選，成績優秀者可獲得南開大學自主選拔錄取資格。
對于在南開大學舉辦的“2011年南開大學全國中學生哲學、藥學、醫學、歷史夏令營”中成績合格，且被認定為南開大學自主選拔錄取人選的考生，如高考總分（含附加分）低于南開大學同類科目在當地的最低錄取分數線（平行志愿省份為最終模擬投檔線），但高于當地同類科目重點分數線，且達到南開大學同類科目在當地最低錄取分數線（平行志愿省份為第一次模擬投檔線）下30-40分（出分報考志愿的省份30分，考前、估分填報志愿的省份40分）時，在專業服從調劑的情況下，經報省級招辦審批同意后錄取在協議規定專業。凡屬降分錄取的考生進入指定專業后一律不允許申請轉專業。
此外，據了解，對于在南開大學“2011年南開大學數學夏令營”中成績合格，且被認定為我校自主選拔錄取人選的考生，如高考總分（含附加分）達到南開大學同類科目在當地最低錄取分數線（平行志愿省份為第一次模擬投檔線）時，在專業服從調劑的情況下，經報省級招辦審批同意后錄取在協議規定專業。
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